毛细管预柱使用在如下方面：

样品中含有粘稠状的杂质，或者样品本身呈粘稠状

样品中含有腐蚀性物质，与色谱柱涂覆的固定相发生反应或者有腐蚀性

样品中含有难以汽化的物质，而这些物质不需要检测。

样品中含有杂质组份较多，即俗称“样品较脏”

当以上情况出现时，色谱柱统一表现为色谱柱的寿命会缩短。
 
一般情况下，样品会沉积在接“进样口”端一米的范围之内，故毛细管预柱长度为一般为1.5米，用毛细管专用连接件将毛细管预柱与色谱柱连接起来，使用过程中，只需更换预柱即可。
 
使用示意图如下：